植物叶绿体基因组在理解植物系统发育、植物物种鉴定等方面具有重要作用，而水生植物叶绿体基因组的缺失、平移和倒位现象在水生植物中大量存在，这些现象发生的时期如何？对理解物种的系统发育的作用如何，还需要更多的证据支撑。中国科学院武汉植物园和深圳市中国科学院仙湖植物园研究人员合作，以穗状狐尾藻(Myriophyllum spicatum)为研究材料，测定其叶绿体基因组，发现穗状狐尾藻存在trnE-trnC之间存在4kb的倒位，进一步以该区域为研究对象，对狐尾藻属(Myriophyllum)14个物种和小二仙草科(Haloragaceae)其他物种进行了比较，结果表明，该倒位仅在狐尾藻属植物中广泛存在，推测其形成于狐尾藻属分化前的上白垩纪（72.54 MYA）与中新世（47.28 MYA）之间，而这个倒位的发生可能是来源于与K-pg时期气候剧烈变化相关的的非随机重组。以上结果对于理解小二仙草科的系统演化具有重要作用。
本研究成果以“The complete chloroplast genome of Myriophyllum spicatum reveals a 4-kb inversion and new insights regarding plastome evolution in Haloragaceae”为题，发表于国际学术期刊Ecology and Evolution。中国科学院水生植物与流域生态重点实验室、武汉植物园水生植物生物学学科组副研究员刘帆为通讯作者。这项工作得到了中国科学院战略先导专项项目(XDB31010104)、和国家自然科学基金（31670369）的资助。
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